Hastalık genelde ilerleyici bir karakter gösteriyor. Yaygınlığı ancak laparoskopi ile anlaşılabilir. Çikolata kistleri dört evrede sınıflandırılıyor. Evre 1’de karın içinde sadece milimetrik çikolata kistleri varken, Evre 4’de yayılmış olabiliyor. İleri evreler dediğimiz Evre 3 ve Evre 4’de kısırlık gelişebiliyor. Erken evrelerde de (1 ve 2) yumurta, sperm veya embriyo üzerinde olası olumsuz etkiler nedeniyle hamile kalmakta sıkıntı yaşanabiliyor. Diğer taraftan yumurtalık içindeki çikolata kistleri daima iyi huyludur. Pratik olarak bu kistlerin çeperinde kanser olma ihtimali binde dört, altı düzeyindedir.